Доминион и Королева Клинков.
После уничтожения Тарсониса и падения Конфедерации большинство Терранов, которым посчастливилось выжить, присягнули на верность "Сынам Корхала" , ставшим главной силой сопротивления инопланетным захватчикам. Правители целых планет обращались к Менгску за помощью и вскоре тот объявил , что для защиты всех терранских миров от угрозы инопланетного вторжения необходимо основать новое государство. Так был создан Доминион Терранов, а Менгск провозгласил себя его императором , торжественно заявив о том, что скоро все враги будут побеждены.
В это время Рейнор , глубоко переживал гибель Сары, осознал ,что её связывали с ней глубокие чувства, чем просто дружба. Будучи не в силах смериться с потерей и мрачными воспоминаниями, он поклялся её именем восстановить справедливость. Рейнор, угнал "Гиперион" флагманский крейсер флота Менгска, и отбыл в неизвестном направлении. Но Рейнор не знал того что Керриган не погибла .
Сверхразум-высшее существо контролирующий роем Зергов-заразил Керриган эволюционирующим вирусом вирусом зергов, который наделил её невероятной физической силой и ещё более развил её псионные способности. Керриган превратилась в Королеву Клинков-верную слугу Сверхразума, полностью лишенную морали и этики. Единственное, что теперь имело для него значения, Рой!
Однако в это же время Сверхразум был нанесён неожиданный и мощный удар. Был убит одно из Церебралов-существ, помощью которых Сверхразум управлял всем Роем. Это сделал Зератул, прелетат тёмных тамплиеров-касты Протоссов, давным-давно изгнанных с их древней родины. С гибелью Церебрала все Зерги, находившиеся под его контролем, стали неупрявляемы и напали на своих же собратьев. Рою пришлось их уничтожить.
Впрочем , Зерги быстро оправились от удара. Более того, в момент убийства Церебрала Зератулом, между Тамплиером и Сверхразумом установился краткий телепатический контакт, в результате которого Сверхразуму стало известно, где находится родной мир Протоссов планета Айур. Зерги напали на Айур и несмотря на яростное сопротивление Протоссов зерги сумели захватить родную планету протоссов. Сам Сверхразум переместился на планету и продолжал руководить вторжением Зергов уже на месте.